パターン検索

パターン検索

登録されている配列パターンを複数選択して、カレント配列中に存在するパターンを検出します。
検索時にパターンを新規入力して検索することも可能です。検索範囲指定可能で、検索対象ストランド，も指定できます。
1～２文字のミスマッチ検出可能。CDS領域あるいは遺伝子間領域の探索領域も指定可能です。
CDSの上流・下流指定領域のみの検索可能です。また、複数配列を検索対象として設定可能です。
検索結果画面では、パターン毎に検出個数、配列上の位置、上流下流の遺伝子を表示可能です。
また、結果を新規フィーチャーとして自動登録が可能です。
CSV/FastA形式で結果をファイル出力が可能です。
検索結果リストの行をクリックすると、メインフィーチャーマップはそのパターンの位置がマップの中央となるように移動し、配列レーン上の該当するパターン配列がハイライトされます。

カテゴリパターン検索の記事一覧
タイトル	更新日	参照数
IMC W33A Amino Acid Profile's Motif List 設定ダイアログ	2018年11月07日	参照数: 783
IMC W717 Amino Acid Profile タブペインの説明	2018年11月06日	参照数: 784