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パターン検索

  • 登録されている配列パターンを複数選択して、カレント配列中に存在するパターンを検出します。
  • 検索時にパターンを新規入力して検索することも可能です。検索範囲指定可能で、検索対象ストランド，も指定できます。
  • 1～２文字のミスマッチ検出可能。CDS領域あるいは遺伝子間領域の探索領域も指定可能です。
  • CDSの上流・下流指定領域のみの検索可能です。また、複数配列を検索対象として設定可能です。
    検索結果画面では、パターン毎に検出個数、配列上の位置、上流下流の遺伝子を表示可能です。
  • また、結果を新規フィーチャーとして自動登録が可能です。
  • CSV/FastA形式で結果をファイル出力が可能です。
  • 検索結果リストの行をクリックすると、メインフィーチャーマップはそのパターンの位置がマップの中央となるように移動し、配列レーン上の該当するパターン配列がハイライトされます。
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