eShop in silico: eショップインシリコ

配列レーンには、現在ロードされている塩基配列ファイルの塩基および、もしそこがコーディング領域である場合はアミノ酸配列がそれぞれストランド別に表示されます。

配列レーンはフィーチャーマップのどの位置にも配置することができます。必要であれば2個以上の配列レーンを１つのフィーチャーマップ上に配置できます。

塩基4種類とアミノ酸20種類はそれぞれ個別に異なるカラーで表示することができます。

描画カラーおよびフォントサイズの変更は、フィーチャーセッティングのSequence Lane タブペインで行います。

アミノ酸1文字コードをコドンのどの位置に置くかを変更することができます。

スタートコドン候補やストップコドンの位置を示す矩形をフレーム表示領域に表示できます。

フォントタイプの変更はできません。

• 上図は、Forward StrandにあるCDS、rRNA、tRNAを3フレーム表示にした フィーチャーレーン のサンプルです。
• フィーチャーレーン設定ダイアログ からは以下の機能が実行できます。
• 表示フィーチャーキー（複数）選択、ストランド選択、配置方法（Six Lane, Three Lane, Two Lane, One Lane, Pack)、表示鎖変更(Forward, Reverse, Both)、エクソン 表示方法変更、配置密度、レーンの高さ変更、オフセット 変更。

• コンテント・プロファイルレーン設定ダイアログから設定可能な項目は以下の通りです。
• レーン高さ変更、表示コンテント選択（GC Contentなど6コンテント、GC/AT Skew, Cumulative GC/AT Skew, Import Map Data, Fickett Profile)、背景色変更、プロファイルグラフのパラメータ変更、スライディングウィンドウパラメータ変更、間引き機能、グラフカラー変更。

Navigation Laneは、Feature Map全体の鳥瞰地図を表示し、スライダでFeature Mapの表示位置を移動することができます。

• ナビゲーションレーン設定ダイアログから変更可能な項目は以下の通りです。
• 表示対象フィーチャー（複数）選択可能。ストランド選択(Forward, Reverser, Both)、配置方法選択（Six Lane, Three Lane, Two Lane, One Lane, Pack)、間引き設定変更。

• 制限酵素レーン設定ダイアログから変更可能な項目は以下の通りです。
• レーン高さ、セット切替、制限酵素リストの絞り込み（認識配列長、パリンドローム性、末端形状（Blunt, Sticky)、DAM/DCM、対象配列の切断箇所数、制限酵素の選択。

• Frame Laneは6個のフレーム別にストップコドンが連続して出現しない領域を表示するレーンです。
• 6個のフレーム毎にストップコドンからストップコドンまでが指定コドン数以上ある領域を示します。
• ストップコドンの存在しない領域を右クリックして、新規フィーチャーとして登録できます。

発現プロファイルレーンは、遺伝子発現プロファイルを表示するレーンです。（アレイエディション以上に実装）