eShop in silico

生物種別の任意の代謝パスウェイを生成し、可視化するソフトウェアです。

機能概要

• ゲノムスケールモデルのロード機能
• 注釈付きゲノム配列データのロード機能
• 代謝パスウェイ描画機能
  • サブシステム別ローカルパスウェイ描画機能
  • 指定した化合物からのパスウェイ伸長
  • 複数のローカルパスウェイを1個のパスウェイに合成する機能
  • 指定した２つの化合物閑の最短パスウェイを検索し、パスウェイ上にルート表示する機能
• 代謝パスウェイ印刷機能（描画したパスウェイをpng形式で画像出力します）

使用データ形式

• ゲノムスケールモデルデータ形式：　XML, Matlab, CSV
• 注釈付きゲノム情報ファイル形式：　GenBank

ソフトウェアの動作環境

• 動作OS: MacOS 11, 12, 13 および Windows 11
• 動作Platform： MATLAB (2022b 以降）

納品形式

• データファイルはUSBメモリーに格納され、納品されます。また、データが更新された場合はダウンロードサービスがあります。