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MLD_MPVE MetabolicPathwayVisualizer

生物種別の任意の代謝パスウェイを生成し、可視化するソフトウェアです。

 

機能概要

  • ゲノムスケールモデルのロード機能
  • 注釈付きゲノム配列データのロード機能
  • 代謝パスウェイ描画機能
    • サブシステム別ローカルパスウェイ描画機能
    • 指定した化合物からのパスウェイ伸長
    • 複数のローカルパスウェイを1個のパスウェイに合成する機能
    • 指定した2つの化合物閑の最短パスウェイを検索し、パスウェイ上にルート表示する機能
  • 代謝パスウェイ印刷機能(描画したパスウェイをpng形式で画像出力します)

使用データ形式

  • ゲノムスケールモデルデータ形式: XML, Matlab, CSV
  • 注釈付きゲノム情報ファイル形式: GenBank

ソフトウェアの動作環境

  • 動作OS: MacOS 11, 12, 13 および Windows 11
  • 動作Platform: MATLAB (2022b 以降)

納品形式

  • データファイルはUSBメモリーに格納され、納品されます。また、データが更新された場合はダウンロードサービスがあります。

SureServer for SAKURA(EV)

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