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MDC-GSEG GenomeScaleModel用データ(Euglena) 概要

ゲノムスケールモデル生成や解析に必要なデータを一式取り揃えました。

このデータを使用してEuglena (Euglena gracilis)に関するゲノムスケールモデルを構築することができます。

動作環境

  • 動作OS: MacOSX.15以降 および Windows 10以降
  • 動作Platform: MATLAB (2022b 以降)

データ内容

  • Euglena代謝モデル基本データ
    • 近縁種モデルデータファイル一式
  • 反応データ(Universal Reaction データを含みます)
  • 化合物データ(Universal Metabolite データを含みます)
  • 相同性検索用Blastデータファイル一式
    • 近縁種ゲノムおよびProtein Non Redundant データファイル一式)
  • 各種ID対応表データ
  • その他

データ形式

  • データはテキスト形式(Excel CSV形式)およびXML形式(SBML形式)で提供されています。

対応ソフトウェア

  • このデータは当社が販売するソフトウェアから使用できます(ただし、当データ一式を必要とするソフトウェアのみ)。
  • このデータ一式は通常のエディターソフトで閲覧・編集可能です。

納品形式

  • データファイルはDVDに格納され、納品されます。また、データが更新された場合はダウンロードサービスがあります。

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