ゲノムスケールモデル生成や解析に必要なデータを一式取り揃えました。
このデータを使用してEuglena (Euglena gracilis)に関するゲノムスケールモデルを構築することができます。
動作環境
- 動作OS: MacOSX.15以降 および Windows 10以降
- 動作Platform: MATLAB (2022b 以降)
データ内容
- Euglena代謝モデル基本データ
- 反応データ(Universal Reaction データを含みます)
- 化合物データ(Universal Metabolite データを含みます)
- 相同性検索用Blastデータファイル一式
- 近縁種ゲノムおよびProtein Non Redundant データファイル一式)
- 各種ID対応表データ
- その他
データ形式
- データはテキスト形式(Excel CSV形式)およびXML形式(SBML形式)で提供されています。
対応ソフトウェア
- このデータは当社が販売するソフトウェアから使用できます(ただし、当データ一式を必要とするソフトウェアのみ)。
- このデータ一式は通常のエディターソフトで閲覧・編集可能です。
納品形式
- データファイルはDVDに格納され、納品されます。また、データが更新された場合はダウンロードサービスがあります。