eShop in silico

ゲノムスケールモデル生成や解析に必要なデータを一式取り揃えました。

このデータを使用してEuglena (Euglena gracilis)に関するゲノムスケールモデルを構築することができます。

動作環境

• 動作OS: MacOSX.15以降 および Windows 10以降
• 動作Platform： MATLAB (2022b 以降）

データ内容

• Euglena代謝モデル基本データ
  • 近縁種モデルデータファイル一式
• 反応データ(Universal Reaction データを含みます）
• 化合物データ(Universal Metabolite データを含みます）
• 相同性検索用Blastデータファイル一式
  • 近縁種ゲノムおよびProtein Non Redundant データファイル一式）
• 各種ID対応表データ
• その他

データ形式

• データはテキスト形式（Excel CSV形式）およびXML形式（SBML形式）で提供されています。

対応ソフトウェア

• このデータは当社が販売するソフトウェアから使用できます（ただし、当データ一式を必要とするソフトウェアのみ）。
• このデータ一式は通常のエディターソフトで閲覧・編集可能です。

納品形式

• データファイルはDVDに格納され、納品されます。また、データが更新された場合はダウンロードサービスがあります。