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MDC-GSEC GenomeScaleModel用データ(大腸菌) 概要

ゲノムスケールモデル生成や解析に必要なデータを一式取り揃えました。

このデータを使用して大腸菌に関するゲノムスケールモデルを構築することができます。

また、作成されたモデルの解析に必要なデータも揃えました。

動作環境

  • 動作OS: MacOSX.15以降 および Windows 10以降
  • 動作Platform: MATLAB (2021b 以降)、Python3 (MATLAB, および python3 は納品されません。別途入手いただきます)

データ内容

  • 代謝モデル基本データ
  • コンパートメントデータ
  • 反応データ
  • 化合物データ
  • 各種ID対応表データ
  • その他

データ形式

  • データはテキスト形式(Excel CSV形式)で提供されています。
  • 他にPython Dic形式の補助データがあります。

対応ソフトウェア

  • このデータは当社が販売するソフトウェアから使用できます(ただし、当データ一式を必要とするソフトウェアのみ)。
  • このデータ一式はExcelで閲覧・編集可能です。

納品形式

  • データファイルはDVDに格納され、納品されます。ご希望によりダウンロードも可能です。

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