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MGS-FGAO GenomeScaleModel Fungi/Aspergillus oryzae 概要

このゲノムスケールモデルは、Aspergillus oryzaeに基づき作成されています。

モデルデータはXMLフォーマットおよびSBMLフォーマットで提供されており、付属する解析用スクリプトを利用してあるいは直接MATLAT/CobraToolboxを使用して各種解析を実行することができます。

このゲノムスケールモデルはカスタマイズすることが可能です。

このゲノムスケールモデルのMetabolite ID / Reaction IDはBiGG-IDに基づいています。

製品名称

  • ゲノムスケールモデル(BiGG-ID付加済み):Aspergillus oryzae

製品番号

  • MGS-FGAO

対象ゲノム

  • Fungi / Aspergillus oryzae

データ形式

  • SBML フォーマット
  • Excel フォーマット

付属解析ソフトウェア

  • このゲノムスケールモデルを解析するためにMATLAB上で動作する解析スクリプトが付属しています。

必要ソフトウェア

  • MATLAB
  • CobraToolbox

付属情報

  • Metabolite ID対応リスト
  • Reaction ID対応リスト

納品形式

  • ゲノムスケールモデルはDVDに格納され、納品されます。ご希望によりダウンロードも可能です。

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