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eShop in silico 使用期限付きライセンス製品

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MLC-MGRM GSModelGenerator RM 概要

GSModelGenerator from RelatedModel (MLC_MGRM) は生物種(株)のゲノム情報から、その生物独自のゲノムスケールモデルを生成します。

動作環境

  • 動作OS: MacOSX.14以降 および Windows 10
  • 動作Platform: MATLAB (2020a 以降)、Java8, Python3 (MATLAB, Java8 および python3 は納品されません。別途入手いただきます)
  • 必要外部ソフトウェア/データベース
    • COBRAToolbox V3.0 (COBRAToolbox は納品されません。別途入手いただきます)
    • SBMLToolbox (SBMLToolBox は納品されません。別途入手いただきます)

モデル生成機能

  • 原核生物および真核生物種に対応しています。
  • 目的とする生物種株についてのアノテーション付きアミノ酸配列情報を入力データとして使用します。
  • 参照するデータは、参照生物種のアミノ酸配列情報、既存ゲノムスケールモデルです。
  • 目的とする生物種のゲノムスケールモデルが出力されます。

解析機能

  • 自動生成されたゲノムスケールモデルを編集できます。
  • 生成されたゲノムスケールモデルのバリデーション解析を実行可能です。
  • 生成されたゲノムスケールモデルについてFBA, FVAをはじめとするモデル解析機能を実行可能です。

データ形式

  • 使用するデータはすべてテキストフォーマットにて記述されています(一部、圧縮されたデータがありますが、これらはすべてテキスト形式に展開可能です)。このため、通常のテキストエディターで直接編集することができます。

カスタマイズ

  • このソフトウェアはカスタマイズ可能です。

他製品との連携機能

  • 当社の販売する他製品との連携が可能です。

納品形式

  • データおよび必要なプログラムはDVDあるいはUSBメモリーに格納され、納品されます。ご希望によりダウンロード納品も可能です。

eShop 製品一覧

選択中のライセンスに対応する試用版

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