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MLC-MMCP MetaModelComparator 概要

GSMDesignChecker (MLC_MMCP) は多数のゲノムスケールモデルを比較し、共通集合ゲノムスケールモデル、和集合ゲノムスケールモデルを生成します。

動作環境

  • 動作OS: MacOSX.14以降 および Windows 10
  • 動作Platform: MATLAB (2019b 以降)、Java8, Python3 (MATLAB, Java8 および python3 は納品されません。別途入手いただきます)
  • 必要外部ソフトウェア
    • COBRAToolBox V3.0 (COBRAToolBox は納品されません。別途入手いただきます)
    • Solver (Solver は同梱されません。別途入手いただきます)

モデル形式と編集

  • 10個までのゲノムスケールモデルを同時に比較します。
  • 全体の共通集合ゲノムスケールモデルを生成します。
  • 全体の和集合ゲノムスケールモデルを生成します。
  • 選択された一部のゲノムスケールモデル間の共通集合モデル、和集合モデルを生成します。
  • ID変換辞書を用いて、それぞれのモデルのIDや名称をできるだけ統一します。
  • 真核生物および原核生物のすべてのモデルに対応しています。

解析機能

  • 解析機能はありません。他の製品をご利用ください。

データ形式

  • 使用するデータはすべてテキストフォーマットにて記述されています(一部、圧縮されたデータがありますが、これらはすべてテキスト形式に展開可能です)。このため、通常のテキストエディターで直接編集することができます。

カスタマイズ

  • このソフトウェアはカスタマイズ可能です。

他製品との連携機能

  • 当社の販売する他製品との連携が可能です。

納品形式

  • データおよび必要なプログラムはDVDに格納され、納品されます。ご希望によりダウンロードも可能です。

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選択中のライセンスに対応する試用版

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