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Glossary of terms used on this site

インシリコバイオロジー社の用語集です。

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Glossaries

Term Main definition
A.A.

Amino Acidの略

参照数 - 183
A.A. Mapping

アミノ酸配列を参照ゲノム塩基配列上に相同性を利用してマッピングする機能。マッピング結果はChartViewerで閲覧できる。

参照数 - 210
Synonyms - アミノ酸配列マッピング アミノ酸マッピング
A.A. Profile

蛋白質のアミノ酸の性質を連続的な棒グラフで示したもの。

参照数 - 157
Synonyms - アミノ酸プロファイル
ACE

Phrapアセンブラーの出力ファイルフォーマット。Genome Travler で作成、およびインポートすることができる。ファイル拡張子は、*.ace

参照数 - 155
Add

Add 操作ボタンのこと。追加ボタンともいう。

参照数 - 209
Synonyms - 追加 追加ボタン
AFG

de novo アセンブラーVelvetによるアセンブリ結果ファイルフォーマット。GenomeTravelerでインポートできる。Contigへのマッピング位置情報など。

参照数 - 169
Annotation

塩基配列やアミノ酸配列上のフィーチャーに注釈をつけること

参照数 - 222
Synonyms - アノテーション
Annotation Window

Annotation Window / Viewer

カレントゲノム配列に注釈を編集するためのウィンドウ。

参照数 - 257
Synonyms - アノテーションウィンドウ アノテーションビューア
Apply

ダイアログなどで設定を適用する操作ボタン。

参照数 - 212
AUGUSTUS

ドイツ、ゲッチンゲン大学において開発された真核生物遺伝子予測ソフトウェア。

参照数 - 250
Auto Annotation

自動アノテーション機能。IMCGE以上に実装されている。

参照数 - 215
Synonyms - 自動アノテーション
Auto Copy

ホモロジー検索の結果ヒットしたSubjectから必要な注釈を自動的に転記する機能。自動的にコピーするQualifierを指定できる。IMCに実装。

参照数 - 163
Synonyms - Copy Qualifier 自動転記
BAM

ゲノム配列にマッピングしたリード情報を含むバイナリー形式フォーマット。SAMToolから出力されるフォーマット。GenomeTravelerで読み込み、アラインメント表示できる。

参照数 - 164
Synonyms - Binary Alignment Map
Batch

まとめて実行すること。一括操作。

参照数 - 246
Synonyms - バッチ 一括
Batch Homology Search

多数のフィーチャーをクエリーとして、まとめて相同性検索を実行する機能を示す。IMCGE以上に実装されている。

参照数 - 201
Synonyms - バッチホモロジー検索 一括ホモロジー検索 自動ホモロジー検索