ゲノムスケールモデル生成や解析に必要なデータを一式取り揃えました。
このデータを使用して大腸菌に関するゲノムスケールモデルを構築することができます。
また、作成されたモデルの解析に必要なデータも揃えました。
動作環境
- 動作OS: MacOSX.15以降 および Windows 10以降
- 動作Platform: MATLAB (2021b 以降)、Python3 (MATLAB, および python3 は納品されません。別途入手いただきます)
データ内容
- 代謝モデル基本データ
- コンパートメントデータ
- 反応データ
- 化合物データ
- 各種ID対応表データ
- その他
データ形式
- データはテキスト形式(Excel CSV形式)で提供されています。
- 他にPython Dic形式の補助データがあります。
対応ソフトウェア
- このデータは当社が販売するソフトウェアから使用できます(ただし、当データ一式を必要とするソフトウェアのみ)。
- このデータ一式はExcelで閲覧・編集可能です。
納品形式
- データファイルはDVDに格納され、納品されます。ご希望によりダウンロードも可能です。