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IMC W721 Sequence Viewer タブペインの説明

Sequence Viewer タブペイン では、Sequence Viewer などの表示設定を変更できます。

Sequence Viewer は、メインフィーチャーマップのシーケンスレーンを補完する機能です。

トラディショナルな 配列解析ソフトウェア では塩基配列を改行して表示する形式が多いため、それらの機能になれている利用者を対象としています。

Sequence Viewer Setting セクション

Base per Line (50-100) テキストフィールド: 50~100までの整数を入力します。ここに指定した塩基数で改行されます。

Number of Extra Upstream Bases 入力フィールド:正の整数を入力します。この数値は 配列の切り出し の際に指定領域より上流に余分に切り出し出力する塩基数を指定します。

Number of Extra Downstream Bases 入力フィールド:正の整数を入力します。この数値は 配列の切り出し の際に指定領域より下流に余分に切り出し出力する塩基数を指定します。

Set Screening Qualifiers リスト

チェックしたQualifierを出力ファイルから除去します。

Select All ボタン:クリックすると全部の Qualifier にチェックされます。

Reverse Selected ボタン: クリックすると、チェックされているQualifierのチェックを外し、チェックされていないQualifierがチェックされます。

Feature Setting 共通操作ボタンについてはこちらをご覧ください。