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IMC E04A3 レファレンスフィーチャー配列をクエリー配列として検索

レファレンスフィーチャーマップ上の1つのフィーチャーをクエリー配列として、カレントレファレンスディレクトリー上およびメインフィーチャーマップ上のゲノム塩基配列およびアミノ酸配列に対してBlast検索を実行します。

準備

カレントメインディレクトリにいくつか近縁種ゲノム塩基配列ファイルをロードしておきます。カレントレファレンスディレクトリーにこれもいくつかの近縁種ゲノム塩基配列ファイルをロードしておきます。

(IMCEEとIMCSEでは現在レファレンスゲノムマップに表示されている1つのゲノム塩基配列のみが対象となります。

操作

レファレンスフィーチャーマップ上の1つのCDSフィーチャー上でマウス右クリックします。

メニューが表示されます。そのメニューからShow Homology -> Show Homology AAを選択します。

「Start Homology Search?」という確認メッセージが表示されます。

「はい(Y)」をクリックします。「はい(Y)」をクリックします。

Blast検索が実行され、実行中は進捗メッセージが表示されます。

検索が終了すると「Homology Search」結果ダイアログが表示されます。

結果ダイアログの各ヒットエントリをクリックしていくとメインフィーチャーマップとレファレンスフィーチャーマップの相同遺伝子がアラインメント表示されます。

eShop 製品一覧

IMC EE 1ヶ月
¥972  ¥875
IMC SE 1ヶ月
¥1,944  ¥1,750
IMC EE 3ヶ月
¥2,592  ¥2,074
IMC GE 1ヶ月
¥3,456  ¥3,110
IMC EE 6ヶ月
¥4,104  ¥2,668
IMC SE 3ヶ月
¥5,184  ¥4,147
IMC EE 12ヶ月
¥7,344  ¥3,672
IMC DS 1ヶ月
¥7,560  ¥6,804
IMC GE 3ヶ月
¥9,504  ¥7,603
IMC SE 6ヶ月
¥9,936  ¥6,458
IMC GE 6ヶ月
¥18,144  ¥11,794
IMC SE 12ヶ月
¥19,224  ¥9,612
IMC GE 12ヶ月
¥30,024  ¥15,012

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