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eShop in silico 初期購入ライセンス製品(新規のお客様向け)

初めてIMCライセンスを購入される方向けの製品です
ライセンスは自動継続されません。期限満了時に、継続・更新ライセンス製品からご注文いただきます。

IMC E04A3 レファレンスフィーチャー配列をクエリー配列として検索

レファレンスフィーチャーマップ上の1つのフィーチャーをクエリー配列として、カレントレファレンスディレクトリー上およびメインフィーチャーマップ上のゲノム塩基配列およびアミノ酸配列に対してBlast検索を実行します。

準備

カレントメインディレクトリにいくつか近縁種ゲノム塩基配列ファイルをロードしておきます。カレントレファレンスディレクトリーにこれもいくつかの近縁種ゲノム塩基配列ファイルをロードしておきます。

(IMCEEとIMCSEでは現在レファレンスゲノムマップに表示されている1つのゲノム塩基配列のみが対象となります。

操作

レファレンスフィーチャーマップ上の1つのCDSフィーチャー上でマウス右クリックします。

メニューが表示されます。そのメニューからShow Homology -> Show Homology AAを選択します。

「Start Homology Search?」という確認メッセージが表示されます。

「はい(Y)」をクリックします。「はい(Y)」をクリックします。

Blast検索が実行され、実行中は進捗メッセージが表示されます。

検索が終了すると「Homology Search」結果ダイアログが表示されます。

結果ダイアログの各ヒットエントリをクリックしていくとメインフィーチャーマップとレファレンスフィーチャーマップの相同遺伝子がアラインメント表示されます。

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