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IMC O10 遺伝子クラスターアラインメントを描くには

近縁種ゲノム 間の 遺伝子クラスターアラインメント を行う方法を説明します。

  • この機能は以下の IMCエディション で使用できます。
  • IMC GE  AE DS

操作

  1. カレントレファレンスディレクトリー に比較したい注釈付き(遺伝子同定済) ホールゲノム塩基配列 をロードします。
  2. レファレンスフィーチャーマップ の一つのゲノムの着目する遺伝子(CDS)の上でマウス右クリックします。
  3. 表示されるメニューから「Gene Cluster Alignemt」を選択します。
  4. 実行ダイアログ が表示されます。RUNをクリックします。
    • 実行確認メッセージ が表示されます。
  5. 「はい(Y)]をクリックします。
    • 実行が開始され、終了すると Binary Best Hit List ウィンドウが表示され、レファレンスフィーチャーマップ 上の 基準遺伝子 の周辺で相同性のある遺伝子間が帯で結合されます。
  6. 1つのゲノムをスクロールしても、それにつれて帯は移動しますが、トポロジー は変わりません。
    • ズームを行っても同様です。

 

eShop 製品一覧

IMC EE 1ヶ月
¥972  ¥875
IMC SE 1ヶ月
¥1,944  ¥1,750
IMC EE 3ヶ月
¥2,592  ¥2,074
IMC GE 1ヶ月
¥3,456  ¥3,110
IMC EE 6ヶ月
¥4,104  ¥2,668
IMC SE 3ヶ月
¥5,184  ¥4,147
IMC EE 12ヶ月
¥7,344  ¥3,672
IMC DS 1ヶ月
¥7,560  ¥6,804
IMC GE 3ヶ月
¥9,504  ¥7,603
IMC SE 6ヶ月
¥9,936  ¥6,458
IMC GE 6ヶ月
¥18,144  ¥11,794
IMC SE 12ヶ月
¥19,224  ¥9,612
IMC GE 12ヶ月
¥30,024  ¥15,012

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