GenomeTraveler更新履歴
お知らせ:2010年11月以降のGenomeTravler更新履歴はこちらを参照ください。
| Version | Date | Contents | Type |
| 1.1.11 | 2010/10/15 | ポータブルディスク上に作業領域を確保した場合の処理時間が異常に長い不具合の修正 | バグ修正 |
| 1.1.11 | 2010/10/15 | マッピング処理中に表示されるプログレスメッセージにおいて、Alignment処理項目の表示内容を変更 | 改良 |
| 1.1.10 | 2010/10/8 | SOLiD SR配列のカラースペースマッピング処理をダブルエンコーディング法によって実装 | 新機能 |
| 1.1.10 | 2010/10/8 | SOLiD カラースペースアラインメント表示を実装 | 新機能 |
| 1.1.10 | 2010/10/8 | Linux インストーラ(浮動ライセンス用)を実装 | 新機能 |
| 1.1.9 | 2010/10/5 | IMC Cloningメニューを実装 | 新機能 |
| 1.1.9 | 2010/10/5 | 機器固定ライセンスのライセンスファイル格納位置を保存 | 改良 |
| 1.1.8 | 2010/9/22 | Scaffoldingバグ修正 | バグ修正 |
| 1.1.7 | 2010/9/17 | Linuxインストーラ(固定ライセンス用)を実装 | 新機能 |
| 1.1.7 | 2010/9/17 | Scaffolding アルゴリズムの改良 | 改良 |
| 1.1.7 | 2010/9/17 | Macインストーラのバグ修正 | バグ修正 |
| 1.1.6 | 2010/9/3 | HELPファイル名を変更(内部処理) | 改良 |
| 1.1.6 | 2010/9/3 | 454 SFFファイル読込時の不具合修正 | バグ修正 |
| 1.1.6 | 2010/9/3 | 固定ライセンスファイルの格納位置を自由に設定可能に | 改良 |
| 1.1.6 | 2010/9/3 | ScaffoldingにてScaffoldのreverse complement切換え機能実装 | 新機能 |
| 1.1.5 | 2010/9/2 | PairedEndライブラリサイズの分布ヒストグラム表示の改良 | 改良 |
| 1.1.5 | 2010/9/2 | Mapping処理て、同一領域へのマッピングリード数を制限可能に | 新機能 |
| 1.1.5 | 2010/9/2 | FastA形式ファイル出力ツールの実装 | 新機能 |
| 1.1.5 | 2010/9/2 | SFF形式ファイルのインポートにおけるバグ修正 | バグ修正 |
| 1.1.5 | 2010/9/2 | 複数の配列を1つの配列に結合する機能追加(配列間に指定個数のN塩基を挿入可能) | 新機能 |
| 1.1.4 | 2010/8/28 | Scaffold伸長アルゴリズムのバグ修正 | バグ修正 |
| 1.1.4 | 2010/8/28 | Scaffold ViewerのPaired End配列の位置に矛盾がある場合の描画不具合の修正 | バグ修正 |
| 1.1.4 | 2010/8/28 | 各種オプション設定ダイアログのキャンセル時に常に表示していた確認メッセージを非表示に | 改良 |
| 1.1.4 | 2010/8/28 | Mapping処理プログレスメッセージの処理進捗パーセンテージ表示方法変更 | 改良 |
| 1.1.4 | 2010/8/28 | Scaffolding/Mapping処理に使用されたpaired Endライブラリサイズの分布ヒストグラム表示を実装 | 新機能 |
| 1.1.3 | 2010/8/24 | Scaffolding処理のプログレスメッセージにおけるContig表示の不具合修正 | バグ修正 |
| 1.1.3 | 2010/8/24 | IMC機能のReference Windowのズームが連動しない不具合 | バグ修正 |
| 1.1.3 | 2010/8/24 | Scaffolding結果リストに生成されたScaffold数の表示を追加 | 改良 |
| 1.1.3 | 2010/8/24 | Scaffold ViewerのルートツリーノードにScaffold数を追加表示 | 改良 |
| 1.1.3 | 2010/8/24 | Scaffolding実行パラメータのLinkage Size Typeに「Median」を追加 | 改良 |
| 1.1.3 | 2010/8/24 | アラインメントビューアのウィンドウサイズ保存方法を変更 | 改良 |
| 1.1.2 | 2010/8/24 | Scaffolding ListをContig Linkage Listに変更 | 改良 |
| 1.1.2 | 2010/8/24 | Scaffolding Listの表示を通常は非表示に設定 | 改良 |
| 1.1.2 | 2010/8/24 | Linkage ViewerをScaffold Viewerに名称変更 | 改良 |
| 1.1.2 | 2010/8/24 | Scaffold結果のFastA形式ファイル出力は、Multiploe/Single FastAを選択可能に | 改良 |
| 1.1.2 | 2010/8/24 | プロジェクトツリーをカラー表示。Mapping処理の場合は青、Scaffolding表示の場合は緑を使用。 | 改良 |
| 1.1.2 | 2010/8/24 | ScaffoldリストのFastAファイルにてSinglets出力が可能に | 改良 |
| 1.1.2 | 2010/8/24 | Mapping実行パラメータにコンティグのフラグメント数制限を導入 | 改良 |
| 1.1.2 | 2010/8/24 | Scaffolding処理におけるPaired Endマッピング処理方法を改良 | 改良 |
| 1.1.1 | 2010/8/20 | Mappingウィンドウの右最下部パネルの表示が変化しないバグ修正 | バグ修正 |
| 1.1.1 | 2010/8/20 | Contig名称に自動連番を付加 | 改良 |
| 1.1.1 | 2010/8/20 | Scaffoldの表示に逆鎖が関係すると表示が乱れるバグ修正 | バグ修正 |
| 1.1.1 | 2010/8/20 | Scaffolding結果のCSVファイル詳細出力でエラー発生のバグ修正 | バグ修正 |
| 1.1.1 | 2010/8/20 | MappingウィンドウにおいてScaffolding結果参照後にツリーノードが間違って参照されてしまうバグ修正 | バグ修正 |
| 1.1.1 | 2010/8/20 | Scaffolding実行パラメータを追加。paired Endのサイズを設定。最大アラインメント数を設定。 | 改良 |
| 1.1.0 | 2010/8/18 | プロジェクト登録方法をMappingとScaffoldingそれぞれ振り分けて登録可能。Scaffoldingの場合は、コンティグデータを事前登録可能。 | 改良 |
| 1.1.0 | 2010/8/18 | Importing/Mapping/Scaffolding実行パラメータの設定ダイアログの改良。複数のダイアログに分割されていたのを1つの統合。 | 改良 |
| 1.1.0 | 2010/8/18 | Scaffolding結果のLinakge Viewer表示内容に誤りがあるバグ修正 | バグ修正 |
| 1.1.0 | 2010/8/18 | 1つのPaired End配列が複数箇所にマッピングされる場合の処理改良 | 改良 |
| 1.1 | |||
| 1.0.44 | 2010/8/6 | ScaffoldingのLinkage Viewer機能の改良(ツールボックスボタン対応) | 改良 |
| 1.0.43 | 2010/8/4 | ScaffoldingによるLinkage Mapの表示機能 | 新機能 |
| 1.0.42 | 2010/7/29 | Blast Format DBエラーとなる不具合修正 | バグ修正 |
| 1.0.42 | 2010/7/29 | マッピング結果にて「Mapped Net Reads」の数が「Mapped Grosss Reads」よりも大きくなっている不具合の修正 | バグ修正 |
| 1.0.42 | 2010/7/29 | Paired End Mapping アルゴリズムを改良 | 改良 |
| 1.0.42 | 2010/7/29 | マッピング情報表示テーブルの表示項目の追加 | 改良 |
| 1.0.41 | 2010/7/22 | Mac OSでマッピングエラーとなる不具合の修正 | バグ修正 |
| 1.0.41 | 2010/7/22 | Paired End Mapping DialogにてNGS SRの保存はプロジェクト別に振り分けて表示されるように改良 |
改良 |
| 1.0.41 | 2010/7/22 | Paired-Endマッピング/ScaffoldingマッピングダイアログのNGSの設定において、「Add」,「Delete]に加えて「Edit」ボタンを用意 |
改良 |
| 1.0.41 | 2010/7/22 | Scaffolding実行ダイアログでコンティグ配列ファイルとしてFASTAとGenbank/EMBLEファイルを指定可能に | 改良 |
| 1.0.40 | 2010/7/16 | Scaffolding機能を実装 | 新機能 |
| 1.0.39 | 2010/7/9 | AlignmentViewerにてPaired-Endマッピング結果のMatePair表示に誤りがある不具合を修正 | バグ修正 |
| 1.0.38 | 2010/7/7 | 2つ目以降の染色体へのマッピングをおこなおうとするとマッピングエラーが発生してしまう不具合の修正 | バグ修正 |
| 1.0.38 | 2010/7/7 | IMC Array Analysisのメニューを追加 | 新機能 |
| 1.0.37 | 2010/7/2 | PairedEnd Mappingの際のトリミングでデータ範囲を指定しても正しくトリミングされない不具合の修正 | バグ修正 |
| 1.0.37 | 2010/7/2 | ログ出力タイプを最小とすると、進捗ダイアログにメッセージが表示されなくなる不具合の修正 | バグ修正 |
| 1.0.37 | 2010/7/2 | アライメント処理において無駄にメモリを消費する不具合修正 |
バグ修正 |
| 1.0.37 | 2010/7/2 | プロジェクトツリー上に表示されるコンティグノード横に表示される情報のうち、フラグメント要素数の内容に誤りがある不具合を修正 | バグ修正 |
| 1.0.37 | 2010/7/2 | アライメントビューアのナビゲーション領域で表示する際に必要な画像イメージ作成処理速度を短縮 | 改良 |
| 1.0.37 | 2010/7/2 | BLASTのオプション設定項目にペアワイズアラインメント数制限パラメータを追加 | 改良 |
| 1.0.37 | 2010/7/2 | Paired-Endマッピング実行ダイアログにパラメ―タ項目を追加 |
改良 |
| 1.0.36 | 2010/6/25 | イルミナqseq.txtファイルの読み込みを可能 | 改良 |
| 1.0.36 | 2010/6/25 | Array Profile Laneの表示がされたり、表示されなかったりする不具合修正 | バグ修正 |
| 1.0.35 | 2010/6/22 | ローカルCoverage Depthの表示がうまくいかない不具合修正 | バグ修正 |
| 1.0.34 | 2010/6/20 | Alignment Viewerでエラーが表示されるバグ修正(IMC Array版への対応ミス) | バグ修正 |
| 1.0.34 | 2010/6/20 | 2つの染色体同士を比較するために、複数のAlignment Veiwerを同時に表示する機能追加(暫定機能) | 新機能 |
| 1.0.34 | 2010/6/20 | SAM/BAMファイルインポート時に、塩基配列の長さが一致しない場合の処理方法変更 | 改良 |
| 1.0.34 | 2010/6/20 | マッピング処理の省メモリー化 | 改良 |
| 1.0.33 | 2010/6/11 | プロジェクトおよび参照ゲノム登録機能の独立 | 改良 |
| 1.0.33 | 2010/6/11 | IMCArray版に対応 | 新機能 |
| 1.0.33 | 2010/6/11 | インストール結果の参照が可能に | 改良 |
| 1.0.33 | 2010/6/11 | マッピング処理が停止するバグ修正 | バグ修正 |
| 1.0.33 | 2010/6/11 | オプション設定の不具合修正 | バグ修正 |
| 1.0.33 | 2010/6/11 | アラインメントビューアの表示の不具合修正 | バグ修正 |
| 1.0.32 | 2010/6/4 | メモリー割当計算方法を変更 | 改良 |
| 1.0.32 | 2010/6/4 | 「LAST」を指定してマッピングするとMappping Errorとなる不具合修正 |
バグ修正 |
| 1.0.31 | 2010/6/4 | IMC機能追加:相同性検索 | 新機能 |
| 1.0.31 | 2010/6/4 | 「Alignment Viewer」で描画中にエラーメッセージが多発する不具合修正 | バグ修正 |
| 1.0.31 | 2010/6/4 | 固定ライセンスで更新期限の日付が正しく表示されない不具合修正 | バグ修正 |
| 1.0.30 | 2010/6/3 | IMC機能追加:フィーチャーキー検索 | 新機能 |
| 1.0.30 | 2010/6/3 | IMC機能追加:キーワード検索 | 新機能 |
| 1.0.30 | 2010/6/3 | IMC機能追加:パターン検索 | 新機能 |
| 1.0.30 | 2010/6/3 | マッピング中に異常終了する不具合の修正 | バグ修正 |
| 1.0.29 | 2010/5/28 | 「Disagreement List」機能にSNP用設定追加 | 新機能 |
| 1.0.29 | 2010/5/28 | 「Pair End Mapping」 メニューの独立 | 新機能 |
| 1.0.29 | 2010/5/28 | 「New」ボタンでダウンロード・自動インストールができない不具合修正 | バグ修正 |
| 1.0.28 | 2010/5/14 | マッピングなしに、GenBankファイルを単独で読込み、表示する機能新規追加 | 新機能 |
| 1.0.28 | 2010/5/14 | SAM/BAMインポート機能の改良 | 改良 |
| 1.0.28 | 2010/5/14 | 空白行の入ったMultiple FastAファイルが読込エラーとなる不具合修正 | バグ修正 |
| 1.0.28 | 2010/5/14 | ウィンドウをリサイズしても一部描画領域がリサイズされなかった問題 | バグ修正 |
| 1.0.28 | 2010/5/14 | ペイン間の連動が行われない場合がある問題の修正 | バグ修正 |
| 1.0.27 | 2010/5/7 | 特定のマッピングノードを開こうとすると、フリーズしてしまう不具合修正 | バグ修正 |
| 1.0.27 | 2010/5/7 | フィーチャーマップペインに指定されていない制限酵素地図プロファイルが表示される不具合修正 | バグ修正 |
| 1.0.26 | 2010/4/22 | 既存SNPsと抽出された変異点比較リスト出力 | 新機能 |
| 1.0.26 | 2010/4/22 | プロジェクトツリーコンティグノードクリック時にプログレスダイアログを表示 | 改良 |
| 1.0.25 | 2010/4/21 | マップされた配列を一つのファイルとして生成する | 新機能 |
| 1.0.24 | 2010/4/16 | CSFastAファイルをマッピングするとマッピングエラーとなる不具合の修正 | バグ修正 |
| 1.0.24 | 2010/4/16 | SAM/BAMインポート、マッピング処理を実行後、マッピングウィンドウのマッピング情報に開始時刻の情報が表示されない不具合 | バグ修正 |
| 1.0.23 | 2010/4/15 | SAM/BAMファイルインポート機能 | 新機能 |
| 1.0.23 | 2010/4/15 | 最新Version Check機能の不具合 | バグ修正 |
| 1.0.22 | 2010/4/9 | Project作成のとき、Chr名が表示されない不具合の修正 | バグ修正 |
| 1.0.22 | 2010/4/9 | AligmentViewerにIMCのSave/Save as/Importボタンを追加 | 改良 |
| 1.0.22 | 2010/4/9 | AligmentViewerプロジェクトツリーノードからポップアップメニュー表示を可能 | 改良 |
| 1.0.21 | 2010/4/2 | CDS上のマウス右クリックで操作できるIMC機能を全て実装 | 新機能 |
| 1.0.21 | 2010/4/2 | メインコントロールウィンドウに「MergeGenbank」ツールボタンと機能を実装 | 新機能 |
| 1.0.20 | 2010/3/24 | 全ゲノムナビゲーションプロファイルが表示されない不具合の修正 | バグ修正 |
| 1.0.20 | 2010/3/24 | Project作成のとき、Chr名が表示されない不具合の修正 | バグ修正 |
| 1.0.20 | 2010/3/24 | Mac OS X.6 Snow Leopardでblastコマンドclustalwコマンドが設定されない不具合の修正 | バグ修正 |
| 1.0.19 | 2010/3/19 | マッピングエラーが発生する不具合 | バグ修正 |
| 1.0.19 | 2010/3/19 | マッピングパラメータ設定で、Use Trimming指定せずにデータ範囲を設定可能 | 改良 |
| 1.0.19 | 2010/3/19 | ピーク検出を実装 | 新機能 |
| 1.0.19 | 2010/3/19 | Splitされた1つのセグメントから別のセグメントに移る時、ズーム度が維持されない不具合の修正 | バグ修正 |
| 1.0.19 | 2010/3/19 | Mac OS X.6(Mac Mini)で、Alignment Viewerのリサイズが不調になる不具合の修正 | バグ修正 |
| 1.0.18 | 2010/3/5 | DisagreementListを表示可能 | 新機能 |
| 1.0.18 | 2010/3/5 | BLASTによる自動マッピングを行うとマッピングエラーとなる不具合の修正 | バグ修正 |
