クローニング
コンピュータ上で分子クローニングのシミュレーションを行うことをインシリコクローニングを読んでいます。インシリコバイオロジー社では、このインシリコクローニングの技術を使って、配列の操作や解析を提供しています。これらの機能はIMC:in silico MolecularCloningシリーズが提供しています。
IMCが提供するインシリコクローニングの種類
- PCRプライマーの設計
- フィーチャーマップ上での自動設計
- 手動登録
- プライマー配列へのタグ配列付加
- プライマー配列への変異挿入
- プライマー配列への制限酵素認識部位の付加
- PCRプライマーの管理
- PCRの実行(インシリコPCR反応)
- 制限酵素による配列の消化と断片化(インシリコ制限酵素消化)
- ライゲーション反応 (インシリコライゲーション)
- 2配列のライゲーション
- 突出末端をもつ断片同士のライゲーション
- 一方の末端が脱リン酸化された断片同士のライゲーション
- 脱リン酸化なしにライゲーション
- セルフライゲーションによる環状DNA生成
- 2配列のライゲーション
- ゲル電気泳動(インシリコ電気泳動)
- 2種の制限酵素によるインサートチェック
- プラスミドマップの描画
- T-Vectorの作成
- TA-Cloning
- DNA末端処理
- リン酸化・脱リン化
- 平滑化
