マッピングインデックス
ISBのソフトウェアには豊富なマッピング機能が搭載されています。
ISB マッピング機能一覧
- EST配列マッピング → IMC GE/AE
- マッピング結果をフィーチャーとして登録できます。
- 各フィーチャーに連番を付加できます。
- 各フィーチャーのQualifierに記述する内容を指定できます。
- アミノ酸配列マッピング → IMC GE/AE
- マッピング結果をフィーチャーとして登録できます。
- 各フィーチャーに連番を付加できます。
- 各フィーチャーのQualifierに記述する内容を指定できます。
- トレース波形データマッピング → IMC GE/AEおよびMGG
- ABI/SCFファイルを参照ゲノム上にマッピングし、波形を表示します。
- SNPsマッピング → IMC GE/AE
- JSNP配列を参照ゲノム上にマッピングし、フィーチャーとして登録します。
- プローブマッピング → IMCAE
- タイリングアレイプローブマッピング
- タイリングアレイプローブ配列をゲノム上にマッピングし、発現アレイ情報を読み込む準備をします。
- 次世代シーケンサ配列マッピング → MGGPWおよびGenomeTravler
- SOLiD マッピング
- SOLiDのCSFastAを参照ゲノム上にマッピングします。
- SOLiDのマッピング結果であるGFFファイルをインポートします。
- Solexaマッピング
- FastQ形式の配列を参照ゲノム上にマッピングします。
- 454マッピング
- FastA形式の配列を参照ゲノム上にマッピングします。
- マッピングによる変異探索
- マッピングされた配列のコンセンサス配列と参照ゲノム配列を比較し、変異箇所を同定します。
