ファイルをインポートする
バイオサイエンス領域のソフトウェアやハードウェア装置から出力されるさまざまなデータファイルを読み込んで、閲覧することは研究の基本的操作です。そのようなファイルがどのソフトウェアで読込み(インポートし)、内容を閲覧したり、編集したりすることが可能か否かを説明します。
ファイル形式
塩基配列ファイル
- 注釈付き塩基配列ファイル
- GenBank形式塩基配列ファイル
- IMC: インポート・注釈表示・編集・出力
- MGG: インポート・アセンブル・マッピング・出力
- EMBL形式塩基配列ファイル
- IMC:インポート・注釈表示・編集・出力
- MGG: インポート・アセンブル・マッピング・出力
- 注釈なし塩基配列ファイル
- FastA形式塩基配列ファイル
- IMC:インポート・編集・出力可能
- MGG: インポート・アセンブル・マッピング・出力
- テキスト形式塩基配列ファイル
- IMC:インポート
- 行番号、スペース付き塩基配列ファイル
- IMC:インポート
- FastA形式塩基配列ファイル
アミノ酸配列ファイル
- 注釈付きアミノ酸配列ファイル
- GPFFファイル
- IMC:インポート・注釈表示・編集・データベース生成・出力
- GPFFファイル
- 注釈なしアミノ酸配列ファイル
- FastA形式ファイル
- IMC:インポート・編集・出力・データベース生成
- FastA形式ファイル
アノテーション情報ファイル(フィーチャー定義ファイル)
- GFF
- IMC:インポート・マッピング・注釈表示・編集
- JSNP
- IMC:インポート・マッピング・注釈表示・編集
- dbSNP
- IMC:インポート・マッピング・注釈表示・編集
- BED
- IMC:インポート・マッピング・注釈表示・編集
シーケンサ出力ファイル
- 従来型シーケンサ出力ファイル
- ABI形式ファイル
- IMC:インポート・マッピング
- MGG:インポート・アセンブル・マッピング
- SCF形式ファイル
- IMC:インポート・マッピング
- MGG:インポート・アセンブル・マッピング
- ABI形式ファイル
- 次世代シーケンサファイル
- Multiple FastA形式ファイル
- MGG:インポート・マッピング
- Mutiple FastQ形式ファイル
- MGG:インポート・マッピング
- Solexa形式ファイル
- Solexa 2
- MGG:インポート・マッピング
- Solexa 2
- SOLiD形式ファイル
- Multiple FastA形式ファイル
マッピング結果ファイル
- ABI SOLiD GFFファイル
- GenomeTraveler:GFFインポート、マッピング結果表示
- MGG:GFFインポート、マッピング結果表示、GFF出力
- SAM/BAM ファイル
- GenomeTraveler:SAM/BAMインポート、マッピング結果表示
アセンブル結果ファイル
- Phrap ACE Screenファイル
- MGG: 手動インポート・出力
アレイ関係ファイル
- Probe定義ファイル
- Affymetrix
- IMCAE: インポート・マッピング
- Agilent
- IMCAE: インポート・マッピング
- Nimblegen
- IMCAE: インポート・マッピング
- Affymetrix
- アレイ発現ファイル
- Affymetrix
- IMCAE: インポート・プロファイル表示
- Agilent
- IMCAE: インポート・プロファイル表示
- Nimblegen
- IMCAE: インポート・プロファイル表示
- Affymetrix
制限酵素ファイル
- GCG形式ファイル
- IMC: インポート
プライマーファイル
- IMC独自形式ファイル
- IMC: インポート
遺伝子同定結果ファイル
- Glimmer
- IMC: インポート・マッピング・注釈表示
- GeneScan
- IMC: インポート・マッピング・注釈表示
- tRNAScan-SE
- IMC: インポート・マッピング・注釈表示
- MetaGeneAnnotator
- IMC: インポート・マッピング・注釈表示
- RNAmmer
- IMC:インポート・マッピング・注釈表示
- AUGUSTUS
- IMC:インポート・マッピング・注釈表示
相同性検索結果ファイル
- Blast出力ファイル
- IMC: インポート・マッピング・注釈表示
