CSFastA フォーマット
CSFastA形式ファイル
次世代シーケンサSOLiDの一次ファイルとして使用されています。塩基配列ではなく、カラースペースコードで記述されています。
フォーマット形式 記号の意味
[
@配列名「改行」
塩基配列
+[配列名]「改行」
Quality Value列(; 区切り)
]
フォーマット例
Quality Valueについて
PHRED同等スコアへの変換
- PHRED_QV = FastQ_QV - 33.
- PHRED_QV = 10*log(1+10**(solexa_QV - 64)/10))/log(10).
