アレイ解析インデックス

Array Analysis

概要

タイリングアレイとは、ゲノム全体をそのプローブセットで隙間なく覆い尽くすプローブをもつアレイを示します。
- 準タイリングアレイとは、完全に隙間なく覆い付くすのではなく、少し隙間を許容するタイリングアレイを示します。
遺伝子レベルアレイとは、遺伝子上の特異的な配列をプローブとして主として遺伝子全体の挙動を網羅的に把握するアレイを示します。
- Affymetrixの遺伝子レベルアレイでは、ひとつの遺伝子上に20個程度のプローブをもち、その平均値を使って、遺伝子発現量を測定します。
- Agilentの遺伝子レベルアレイでは、通常1個の遺伝子上に1個のプローブをもっており、その発現量が遺伝子の発現量となります。