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2010年8月9日
配列操作
配列を入手する
系統樹をたどる
配列を読込む
配列を書出す
配列を結合する
読込む
遺伝子同定結果
注釈を読み込む
アノテーション情報
相同性解析結果
アレイファイル
次世代シーケンサ配列
アセンブル結果を読み込む
マッピング結果を読み込む
書出す
塩基配列を
注釈を書き出す
アレイプロファイルを
マッピング結果を
アセンブル結果を
プライマー配列を
計算する・数える
描画・印刷する
クローニング
プライマー設計
プライマー管理
PCR
ゲノム領域を増幅
制限酵素反応
環状ベクターの開環
ライゲーション
セルフライゲーション
ゲル電気泳動
制限酵素消化断片のゲル電気泳動
インサートチェック
配列解析
組成解析
信号解析
核酸配列解析
アミノ酸配列解析
遺伝子解析
DeNovo探索
マッピング探索
クラスタリング探索
相同性解析
相同性検索
検索用データベース作成
相同性検索ソフトの選択
マルチプルアラインメント
任意の配列からマルチプルアラインメント作成
相同性検索に引き続いてマルチプルアラインメントを作成
進化解析
分子進化系統樹
アミノ酸の分子進化系統樹を描く
変異解析
変異部位を発見する
次世代シーケンサデータを使う
従来型ABIファイルを使う
発現解析
アノテーション
ゲノム内解析
ORF抽出
スタートコドン変更
アミノ酸翻訳
複製開始点
逆相補鎖配列生成
比較ゲノム解析
環状ゲノムマップ
多重ゲノムアラインメント
ドットプロット
ゲノムリアレンジメントマップ
Vennダイアグラム
メタゲノム解析
パスウェイ解析
アレイ解析
タイリングアレイ
遺伝子レベルアレイ
次世代シーケンサ
参照ゲノムに貼付ける
マッピング・リシーケンシング
SOLiDデータを貼り付け
Solexaデータを貼り付け
454データを貼り付け
DeNovoアセンブルする
アセンブル
DeNovoアセンブル
マッピング
トレース波形マッピング
EST配列マッピング
アミノ酸配列マッピング
SNPsデータ
NGSフラグメント
ビューア
ゲノムを見る
環状ゲノムマップ
フィーチャーマップ
ゲノム再配置マップ
ベンダイアグラム
ドットプロット
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コンテントマップ
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塩基をカラー表示
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アミノ酸配列カラー表示
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配列ファイル
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GenBank
EMBL
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注釈定義ファイル
GFF
次世代シーケンサファイル
FastQ
FastA
SOLiDファイル概要
SOLiD CSFastA
Solexa 2
アレイプローブファイル
Affymetrix Probe
Affymetrix CDF
Affymetrix BPMAP
Agilent Probe
Nimblegen NDF
アレイ発現ファイル
Affymetrix CELファイル
Agilent Array ファイル
Nimblegen Pairファイル
アセンブルファイル
ABI/SCF
FastA
GenBank
マッピングできるファイル
FastA
FastQ
Solexa
CSFastA
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リリース
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しました
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Ver.1.4-1.5
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