GenomeTraveler 機能一覧
- 新型ギガシーケンサ配列自動マッピング機能
- 他ソフトウェアマッピング結果インポート機能
- マッピングプロファイルビューア機能
- ピーク検出およびフィーチャー登録機能
- 変異箇所抽出およびフィーチャー登録機能
- アノテーション機能
- GenBank/EMBL/DDBJファイル生成機能
- 各種設定・ユーティリティ機能
新型ギガシーケンサ配列自動マッピング機能
新型ギガシーケンサ配列を参照ゲノム配列上に自動的にマッピングします。参照ゲノム配列は、注釈が付加されたGenBank/EMBL形式ファイルを指定できます。
GenomeTravelerマッピング可能配列データフォーマット
- 新型シーケンサ配列データ
- FastQ
- CSFastA
- Solexa Raw
- キャピラリーシーケンサ配列データ
- ABI
- PHD
- SCF
- その他の配列データ
- FastA
- GenBank
- EMBL
- Plain Text
参照ゲノム塩基配列データフォーマット
- 注釈付き塩基配列データ
- GenBank
- EMBL
- 注釈なし塩基配列データ
- FastA
他ソフトウェアによるマッピング結果インポート機能
- SOLiD GFF形式マッピング結果ファイル
- SAM/BAM形式マッピング結果ファイル
マッピングプロファイル・アラインメントビューア機能
- 全染色体Coverage Depthプロファイルビューア
- ナビゲーション付き
- ピーク検出機能
- ローカルCoverage Depthプロファイルビューザ
- ナビゲーション付き
- ピーク検出機能
ピーク検出およびフィーチャー登録機能
- プロファイルからのピーク検出機能
- 検出ピークのフィーチャーとしての登録機能
変異箇所抽出およびフィーチャー登録機能
- 変異部位抽出機能
- 変異部位と既知SNPとの対応表生成
アノテーション機能
- Annotation Windowによる手動アノテーション
GenBank/EMBL/DDBJファイル生成機能
- 検出したピークや変異部位などをフィーチャー登録し、GenBank/EMBLファイルとして保存
各種設定・ユーティリティ機能
